يتضمن مركز قطر لإعادة التأهيل مختبراً شاملاً، متعدد الاختصاصات، ومجهزاً بأحدث المعدات والتقنيات المخبرية. ويُعنى هذا المختبر بإجراء ومعالجة مجموعة واسعة من الاختبارات والتحاليل المخبرية لضمان وصول جميع الفرق العاملة بالمركز إلى المعلومات اللازمة لتشخيص حالة المريض ومراقبة مستوى تقدم حالته أثناء تلقيه العلاج.
يضم المختبر فريقاً متخصصاً من التقنيين والفنيين الطبيين الذين يتمتعون بخبرة واسعة في استخدام المعدات المخبرية المتقدمة.
تقع المختبرات في الطابق الثالث من مركز قطر لإعادة التأهيل.
